「同期ブラウジング」がアップロードミスの防止に役立ってます

良いポイント

FFFTP を使用していましたが、アップデート頻度が低くセキュリティ面で不安があったことから、Filezilla を試用し感触がよかったことからこちらに移行しました。
Windows・Mac 対応という点も採用の決め手になっています。

主に既存 Web サイトの編集時に試用しています。

実運用では「同期ブラウジング」機能に助けられています。
ローカルとリモートのディレクトリ構造を同期する機能で、開いてるディレクトリ（フォルダ）を一致させてくれるので、アップロード・ダウンロード先を間違う、というミスを防げています。
（本来なら Git を使えばいいと思うのですが、いまいち使いこなせていなくて、、、）

接続するサーバの設定や転送のしやすさは、他の FTP ソフトと大差ないように思います。